Tổng số các loại hoá phẩm nông nghiệp hiện được lưu trữ có thể hơn 37 nghìn tấn, trong đó có 53% được lưu trữ tại khu vực đồng bằng Mê Kông. Bên cạnh các kho lưu trữ, theo điều tra tại 39 tỉnh thành trong cả nước thì có đến hơn 730 nghìn hoá phẩm nông nghiệp không nhãn mác, bao gồm các chai lọ bằng nhựa, thuỷ tinh hay kim loại. Những hoá phẩm này hiện đang vứt bỏ không đúng cách hoặc vẫn được sử dụng. Điều này ảnh hưởng nghiêm trọng đến sức khoẻ của cộng đồng dân cư. Ông Bùi Cách Tuyến, Tổng cục trưởng Tổng cục môi trường cho biết: Mặc dù Bộ NN&PTNT đã cấm nhưng nó vẫn còn tồn kho ở đâu đó hoặc buôn lậu qua đường biên giới vào Việt Nam. Nông dân nên tiếp tục sử dụng nó và tạo ra một mối đe dọa khác cho cộng đồng.
Nhằm xử lý các kho thuốc bảo vệ thực vật POP tồn lưu, bộ TN&MT đã khởi động các hoạt động của dự án “Xây dựng năng lực nhằm loại bỏ hóa chất bảo vệ thực vật POP tồn lưu tại Việt Nam”. Trong đó, dự án sẽ tập trung nâng cao năng lực xử lý và xử lý triệt để các kho thuốc bảo vệ thực vật tồn lưu, ngăn ngừa việc nhập khẩu và sử dụng trái phép các hóa chất bảo vệ thực vật thuộc nhóm POP. Theo ông Hồ Kiên Trung, Trưởng phòng Cải thiện môi trường, Cục quản lý chất thải và cải thiện môi trường, Bộ TN&MT, dự kiến đến khi kết thúc dự án, khoảng 150 tấn hóa chất BVTV thuộc nhóm POP sẽ được tiêu hủy một cách an toàn. Đồng thời, các cơ quan liên quan sẽ có đủ năng lực để xử lý các kho bãi được phát hiện thêm và kiểm soát hiệu quả việc nhập khẩu, sử dụng trái phép các hóa chất BVTV thuộc nhóm POP.
Để giải quyết các vấn đề tồn lưu thuốc bảo vệ thực vật ngoài việc giải quyết các nội dung của ngành nông nghiệp thì cần có sự phối hợp liên ngành nhằm giải quyết, ngăn chặn ngay tình trạng nhập lậu thuốc bảo vệ qua biên giới. Đây là vấn đề giải quyết mang tính bền vững ở nước ta hiện nay. Ngoài ra, nhà nước cũng cần tạo điều kiện cơ sở vật chất, đất đai thuận tiện cho việc lưu giữ thuốc BVTV quá hạn sử dụng và nhập lậu qua biên giới. Các cơ sở cũng cần phải lựa chọn công nghệ tiêu huỷ thuốc BVTV tồn đọng một cách hợp lý, phù hợp với điều kiện của nước ta./.